值得一提的是，贝加尔湖虽然是一个完完全全没有盐分的淡水湖，但是湖里却生活着很多土生土长的海洋生物，比如说海豹、海绵、龙虾等，海豹是哺乳动物，它可以通过肺呼吸，所以当外界的渗透压发生改变的时候，它还是能存活下来的，但是贝加尔湖中还生存着鲨鱼，这就有点令人匪夷所思了。贝加尔湖的海豹非常多，现在每年依旧可以捕获5000头，另外，贝加尔鲟鱼已经完全变成了淡水鱼。所以贝加尔湖到底是湖还是海，一直让人很是迷惑。
贝加尔湖的湖水平均深度达到了730米，但是在湖底，依旧有生物生存，比如说湖底有大量的海绵，而这种海绵可以高达15米，在水下形成丛林，贝加尔湖的湖水十分清澈，晴朗的时候能亮度可达几十米。一些科学家曾经认为，地质史上贝加尔湖曾经是和海洋相连的，后来联系断了，贝加尔湖慢慢因为降水的原因变淡了，但是这种说法貌似说不通。直到如今，科学家也没有弄明白贝加尔湖内的海洋生物到底是从何而来的。
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