"水晶棺"最终未能使用。原因之一是，它仅适用于气候寒冷干燥的北方，若在炎热潮湿的中国南方，遗体最多只能保存20年;另外，此时已经发现，由于初期的防腐处理不够理想，孙中山遗体的皮肤已开始变黑，不可能按照所希望的那样长期保存原先的状态了，使用"水晶棺"已无意义，只能改为土葬。
孙中山"奉安大典"是南京政府成立后主持的一件大事，曾留下十分详尽的历史资料。不过，再细致地记述，也难免遗有漏缺。比如，自1925年孙中山去世后暂厝碧云寺直到1929年奉安大典，在这四年多时间里，有许多关于遗体的传说，其中真假参半，给后人留下不少难解的谜团。
据资料所载，孙中山的遗体曾经数次改殓易棺──所谓"殓"，是指逝者的遗体穿衣入棺，实际上，若将每次易棺算作一殓，孙中山的遗体应为"六殓四棺"。
1925年3月12日，孙中山逝世的当天，遗体便被送往协和医院，涂抹防腐药物，然后手术取出心脏、肠胃等内脏、并用药水洗涤，分别储入玻璃瓶内。清洗腹腔后，排除毛细血管内的空气，由左腿注入浓度40%的福尔马林防腐液，然后缝合创口。3月15日手术完毕，上午10时"举行小殓"，按照民国礼制，身着大礼服、头戴礼帽、足穿皮靴。
孙中山生前曾经说过，自己逝世后，希望能像苏联领袖列宁那样，保留遗体供民众瞻仰。因此，在他病故的第二天，国民党便与苏联政府联系定制安葬列宁时使用的那种"水晶棺"。但"水晶棺"的制作运输尚需时日，"小殓"后只好暂时使用协和医院旧存的一具美式棺木。这具棺木是椭圆形的，头部微方，用美国上等沉香木制作，上面有玻璃隔层，可以瞻仰孙中山遗容。这是"第一殓"、"第一棺"。
苏联以最快的速度用火车将"水晶棺"运往中国。这具棺椁主材为坚木，分为内外两层：外套及上盖均为优质钢材并经镀镍处理，内棺的上盖是可以透视内部的玻璃(并非真正的水晶)。
但是，"水晶棺"最终未能使用。原因之一是，专家认为，它仅适用于气候寒冷干燥的北方，若在炎热潮湿的中国南方，遗体最多只能保存20年;另外，此时已经发现，由于初期的防腐处理不够理想，孙中山遗体的皮肤已开始变黑，不可能按照所希望的那样长期保存原先的状态了，使用"水晶棺"已无意义，只能改为土葬。
"水晶棺"尽管未用，仍应算作"第二棺"。
孙中山灵榇仍按原定时间于4月2日移往碧云寺，放入金刚宝座塔的石龛内。同时，又由协和医院另外制作中式新棺。4月5日清明节，有关人员打开美式沉香木棺，将孙中山的遗体用中式新棺重新装殓。这具棺椁为楠木材质，内壁用耐腐蚀的铝材制作，棺内满盛福尔马林药水，浸没遗体，以达到防腐的目的。棺椁上部装有玻璃盖罩，以便观察内部情况，其上再覆盖楠木棺盖。装殓完毕后，重新放回石龛内。
这是孙中山遗体的第二殓;中式楠木棺为"第三棺"。
接下来的故事极为惊险曲折，而且迷雾重重。
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